Заболевание интенсивно развивается во второй половине вегетации растений в виде мелких, округлых, ржаво-коричневых пустул. Позже на пораженных органах появляются темно-коричневые, почти черные торчащие из-под эпидермиса пустулы. Пораженные листья отмирают, а в пораженных бобах формируются щуплые семена.
Возбудитель болезни — базидиальный гриб Uromyces sojae Syd. порядка Uredinales. Это однодомный паразит, все стадии развития которого происходят на сое. Спермогониальная и эциальная стадии проявляются очень редко. Самые вредные уредино- и телиостадии. Урединиоспоры одноклеточные, яйцевидные, светло-коричневые, 15-20 х 12-20 мкм, с колючей оболочкой. Телиоспоры одноклеточные, округлые, 20-25 мкм в диаметре, коричневые, с сосочковидной верхушкой на удлиненной ножке.
Зимует гриб в виде телиоспор, из которых весной образуются базидии с базидиоспорами. От них происходит первичное заражение сои с образованием спермогональной и эцидиальной стадий гриба. Эцидиальную стадию патогена формирует только один раз. При заражении растений от эциоспора образуется грибница, на которой появляются урединии с урединиоспорами. Гриб может давать 2-3 генерации урединиостадии на растении, а телиостадия — телии с телиоспорами — образуются в конце вегетации. При сильном развитии ржавчины недобор урожая зерна может достигать 15-20%.
Зимует на зараженных растительных остатках. Развитию ржавчины способствуют частые осадки, обильные росы и температура воздуха 20-25°C. Сухая и жаркая погода сдерживает развитие заболевания.