Шеечная гниль особенно вредна при хранении лука, чаще поражает лук-репку и лук-шалот. Болезнь начинается в основном с шейки луковицы. Пораженная ткань размягчается, буреет, становится водянистой, а на ее поверхности образуется серый налет конидиеносцев и конидий гриба. Позже он становится пылистым, и на нем появляются мелкие черные склероции, соединяющиеся в сплошную черную корочку. При интенсивном развитии гнили налетом покрывается почти вся луковица. При вскрытии пораженных луковиц ткань имеет вид вареной. Листья пораженных луковиц бледнеют, быстро увядают, гниют и засыхают.
Заражение лука происходит в поле, но в период вегетации растения устойчивы против болезни. Болезнь проявляется спустя 1-1,5 месяца после хранения. В хранилищах шейная гниль распространяется конидиями. Они образуются на концах конидиеносцев в виде скопления головок. Прорастают конидии одной ростковой трубкой при температуре 20-25°С и через 48 часов образуют хорошо развитую грибницу. Во время хранения гриб распространяется от больных луковиц до здоровых грибниц, поэтому часто заболевание имеет очаговый характер.
Зараженные луковицы, высаженные в поле, склероции, перезимовавшие на поверхности почвы, а также зараженные семена. В неблагоприятных условиях хранения потери лука от этой болезни могут составлять 50% и более. Способствуют поражению болезнью пойменные суглинистые почвы, ограничивают легкие супесчаные.